Старейший и крупнейший университетский музей России, основан в 1945 году. Музей истории Санкт-Петербургского государственного университета находится в историческом здании Двенадцати коллегий. Коллекция, оформленная в хронологическом порядке, рассказывает о развитии этого учреждения, становлении отдельных наук, известных педагогах и выпускниках. В его залах можно видеть старинную мебель и конспекты, портреты профессоров, рабочее бюро Д.И. Менделеева, весы из лаборатории А.И. Бутлерова, модели типографских машин, изобретенных П.Л. Чебышевым.
Документы и фотографии знакомят посетителей с деятельностью университета в годы Великой Отечественной войны и с современными достижениями. Одним из залов Музея истории Санкт-Петербургского государственного университета является университетская церковь Святых Апостолов Петра и Павла - в ней по пятницам и субботам проходят богослужения. Также при музее работает Выставочная галерея, в которой проводятся художественные выставки.
